论著
张灵钰, 黄伟旭, 蔡雅诗, 李慧娴, 张敏, 闻昌勇, 杨萍, 邹剑明, 陈慧峰
目的 利用高通量mRNA测序和生物信息学技术探讨分次低剂量电离辐射(low dose ionizing radiation, LDIR)诱导人支气管上皮(human bonchial epithelial, HBE)细胞衰老中差异表达mRNA及相关生物学过程与通路。 方法 分别采用0、50、100 、200 mGy剂量辐照HBE细胞7次结束后24和48 h收集细胞,检测衰老相关β-半乳糖苷酶活性和衰老相关分泌表型基因mRNA和蛋白表达水平,采用高通量测序筛选差异表达基因进行基因本体学(GO)和京都基因与基因组大百科全书(KEGG)分析。 结果 分次低剂量辐照HBE细胞衰老阳性面积呈剂量依赖性增加(P < 0.05)。与对照组相比,辐照结束后24和48 h,100 mGy × 7和200 mGy × 7组转化生长因子β1(transforming growth factor-β1, TGF-β1)与基质金属蛋白酶9(matrix metalloprotein-9, MMP-9)基因mRNA水平与蛋白表达均增加。高通量测序显示,与对照组相比各剂量组差异表达mRNA分别有882个、475个和1205个。GO分析表明,各剂量组差异表达mRNA主要富集在细胞周期调节、氮化合物代谢过程的调控、对刺激反应的调节和细胞分裂等生物过程。KEGG分析显示,差异表达mRNA主要富集在细胞周期、细胞衰老、铁死亡等通路。结论 分次LDIR可诱导HBE细胞衰老,衰老细胞中差异表达mRNA相关生物学过程和通路与细胞周期、细胞衰老等有关。